西浦先生らによる実効再生産数の統計モデルを解説＆拡張する試み - StatModeling Memorandum

2020/05/17 18 users MLE github.com リポジトリ 実効再生産数 解説

先日の西浦先生のニコ生の発表を聞いていない人はぜひ聞いてください。 モデルとデータを以下のリポジトリでオープンにしていただいたので、モデルについて僕が分かる範囲内で少し解説を加えたいと思います。 github.com 実効再生産数を推定するコードが2種類ありまして、最尤推定（Maximum Likelihood Estimation, MLE... 続きを読む

COVID-19 日本国内の潜在的な陽性者数を推定する試み - StatModeling Memorandum

2020/04/04 208 users 陽性 仮定 PCR検査 推定 ランダム

日本国内の潜在的な陽性者数を推定することは有益ですが、簡単ではありません。PCR検査がランダムになっていないことが推定を難しくしています。有症状者が検査されやすいというselection biasがあるからです。この記事ではいくつか仮定を置いて潜在的な陽性者数を推定したいと思います。 仮定 全国民のうち潜在的に陽性... 続きを読む

『わけがわかる機械学習』中谷秀洋（著）の書評 - StatModeling Memorandum

2019/08/25 293 users みどりぼん 解釈 理論 中谷さん 中谷秀洋

僕が中谷さんと初めて会ったのはみどりぼんの読書会で、初めて話したのは岩波DSの打ち合わせだったと思います。今でもそんなに親しくはないと思います。しかし、中谷さんのブログは10年ぐらい前から読んでいました。自然言語処理を中心とする機械学習に関連する理論（の解釈）・論文レビュー・数値実験の記事が多く、他... 続きを読む

TensorFlowで統計モデリング - StatModeling Memorandum

2018/12/09 50 users TensorFlow stan 統計モデリング 聴衆 講義

とある勉強会で「TensorFlowで統計モデリング」というタイトルで講義をしました。聴衆はPythonユーザが多く、データ量が大きい問題が多そうだったので、StanよりもTensorFlowで点推定するスキルを伸ばすとメリットが大きいだろうと思ってこのようなタイトルになりました。 発表資料は以下になります。 TensorFlowで統計... 続きを読む

Tokyo.R#70で「統計モデリングで癌の5年生存率データから良い病院を探す」というタイトルで話しました - StatModeling Memorandum

2018/06/09 23 users TokyoR ATND 統計モデリング R Stan タイトル

2018 - 06 - 09 Tokyo.R#70で「統計モデリングで癌の5年生存率データから良い病院を探す」というタイトルで話しました R Stan 以下のイベントで話しました。 第70回R勉強会＠東京（#TokyoR）: ATND 発表資料は以下です。 統計モデリングで癌の5年生存率データから良い病院を探す from Kentaro Matsuura 前にやった解析 において、最終的なモデルに... 続きを読む

PythonのSymPyで変分ベイズの例題を理解する - StatModeling Memorandum

2018/03/31 13 users Sympy 例題 PRML Python 変分ベイズ

2018 - 04 - 01 PythonのSymPyで変分ベイズの例題を理解する Python 理論 この記事 の続きです。 ここでは PRML の10.1.3項の一変数 ガウス分布 の例題（ Wikipedia の Variational_Bayesian_methods のA basic exampleと同じ）をSymPyで解きます。すなわちデータが に従い *1 、 と が、 に従うという... 続きを読む

統計モデリングで癌の5年生存率データから良い病院を探す - StatModeling Memorandum

2018/01/31 290 users 統計モデリング stan ダウンロー 良い病院 毎日新聞

2018 - 02 - 01 統計モデリングで癌の5年生存率データから良い病院を探す 現実のデータ Stan 概要 2017年8月9日に 国立がん研究センター は、がん治療拠点の約半数にあたる全国188の病院について、癌患者の5年後の生存率データを初めて公表しました（ 毎日新聞の記事 ）。報告書は 国立がん研究センター が運営するウェブサイトからダウンロードできます（ ここ ）。報告書をダウンロー... 続きを読む

統計・数学・R関連で用途別のオススメ書籍 - StatModeling Memorandum

2018/01/01 356 users 書評 R Stan 数学 数学入門 大学数学

2018 - 01 - 01 統計・数学・R関連で用途別のオススメ書籍 書評 R Stan 比較的読みやすい本を中心に紹介します。2016年も同様の記事を書きましたが新しい本も出たので更新しました。今後はこのページを更新します。 数学入門 かなり前に大学卒業した人が数学に再入門しようと思っても、いきなり大学数学の問題集は解けません。もしくは式変形を眺めて分かった気になるだけで成長がありません。そこ... 続きを読む

『ベイズ統計モデリング ―R,JAGS, Stanによるチュートリアル 原著第2版―』 John Kruschke著、前田和寛・小杉考司監訳 - StatModeling Memorandum

2017/07/22 50 users stan 原著 ベイズ統計モデリング チュートリアル 翻訳

2017 - 07 - 22 『ベイズ統計モデリング ―R,JAGS, Stanによるチュートリアル 原著第2版―』 John Kruschke著、前田和寛・小杉考司監訳 書評 BUGS タイトルの本を頂きました。ありがとうございます。僕は原著を少し読んだことがあり、 こちら で非常に評判が高い本です。翻訳にもかかわらず原著とほぼ同じ値段で購入できます。 先に JAGS になじみのない方へ説明して... 続きを読む

『Pythonで体験するベイズ推論 ―PyMCによるMCMC入門―』の書評 - StatModeling Memorandum

2017/04/05 223 users ベイズ推論 書評 Python 数式 プログラマ

2017 - 04 - 05 『Pythonで体験するベイズ推論 ―PyMCによるMCMC入門―』の書評 Python 書評 特長 Python ユーザが待ちに待った Python による MCMC 本ではないでしょうか。原著タイトルが『Bayesian Methods for Hackers』だけあって、 プログラマ ・エンジニア向きだと思います。数式はびっくりするほど出てこない代わりに、 Py... 続きを読む

統計・R・Stan関連の本、用途別のオススメ10冊 - StatModeling Memorandum

2016/12/24 273 users ヒストグラム 積分 統計 シグマ 書評

2016 - 12 - 24 統計・R・Stan関連の本、用途別のオススメ10冊 書評 R Stan 年末年始向けに、比較的読みやすい本を中心にオススメします。 統計学 入門 色々読んでみましたが、現在決定版と言えるものは存在しないように思えました。個人的には、シグマと 積分 の復習、場合の数・数え上げの方法、確率、確率変数、確率密度、度数分布と ヒストグラム 、代表値・平均・分散、確率分布、同時... 続きを読む