【Cell Ranger】NCBI SRA データをCell Ranger用に準備する方法【scRNA-seq】 - LabCode

2023/08/27 5 users scRNA-seq RNA-Seq LabCode 取得 方法

NCBI（National Center for Biotechnology Information）が提供するSequence Read Archive（SRA）から取得したシーケンスデータでSingle cell RNA-seq解析したいと思いませんか？ この記事は、SRAを10x GenomicsのCell Rangerでデータ処理する方法を解説します。 データの取得から、FASTQファイルのダウンロード、そして... 続きを読む

PubMed内のハゲタカジャーナルに、学術界で懸念の声 | エディテージ・インサイト

2019/06/14 16 users ハゲタカジャーナル NLM 懸念 PubMed 学術界

米国立医学図書館（NLM）の国立生物工学情報センター（NCBI）が運営する、生物医学系論文のアブストラクトや参考文献のリポジトリであるPubMedは、研究者にとって信頼できる文献ソースです。しかし、デジタルリポジトリ内のハゲタカジャーナルの論文の存在に、研究コミュニティで懸念が芽生え始めています。 著者から論... 続きを読む

国際標準化されたデータが、生命を語り始める。 | データ中心科学 リサーチコモンズ Data Centric Science Research Commons

2014/04/01 14 users 生命 国際標準化 データ EBI ゲノム

ゲノムという膨大なデータで科学の進歩やイノベーションが見込まれるバイオ分野は、いち早くデータベース化に取り組んできました。アメリカではNCBI（The National Center for Biotechnology Information）、ヨーロッパではEBI（Part of the European Molecular Biology Laboratory, The European Bi... 続きを読む

自分の尻尾を追いかける犬の動画を400も集めた論文がある - 蝉コロン

2011/12/13 44 users 蝉コロン 尻尾 論文 tails 動画

動物NCBI ROFL: A scientific analysis of 400 YouTube videos of dogs chasing their tails. | Discoblog | Discover Magazine 「NCBIのお茶噴いた論文：イヌが自分の尻尾を追いかけるYouTube動画400についての科学的解析」みたいな訳になるかな。 論文はこちら。PLoS ONE: A ... 続きを読む