【RNA-seq】RaNA-seqを用いたRNA-seq発現量の定量【バイオインフォマティクス】 - LabCode

2024/02/05 11 users バイオインフォマティクス RNA-Seq LabCode

ローカル上でRNA-seq解析環境の整え方がわからない方はいませんか？また自分のPCが推奨環境のものではなく、環境依存のエラーに困っている方はいませんか？ そのような方に向けてブラウザ上でRNA-seq解析データの定量ができるRaNA-seqをご紹介いたします。 RaNA-seqを使える様になると自分のPC上でRNA-seq環境を整える必... 続きを読む

【R】DEseq2を用いた RNA-seq解析データの発現変動遺伝子抽出【RNA-seq】 - LabCode

2023/10/30 13 users RNA-Seq LabCode

RNA-seqデータ解析では、健常者と疾患患者、コントロールと薬剤刺激など、様々な発現変動遺伝子（DEG）を取得するかと思います。しかし、多変量となる遺伝子から手作業でDEGを抽出するのは大変です。 ここでは、DEGの抽出方法としてDEseq2ライブラリを用いて行う方法を解説します。 これによりRNA−seqデータから簡単にDE... 続きを読む

【scRNA-seq】scRNA-seqデータセットを結合する方法【Seurat】 - LabCode

2023/09/20 5 users scRNA-seq seurat LabCode 解析 実験

single cell RNA-seq解析はある程度できるようになったけど、複数のデータセットを扱った解析はまだできないという方はいるのではないでしょうか。 この記事ではsingle cell RNA-seq解析の複数のデータセットを統合する方法を紹介します。 これにより、複数の実験から得られたsingle cell RNA-seq解析データを扱うことが... 続きを読む