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【分子ドッキング】 SwissDockを使ったタンパク質-低分子ドッキング【in silico創薬】 - LabCode
本記事を進むにあたって、UCSF Chimeraのダウンロードをお願いします。 分子ドッキングとは? 分子ドッキングは薬物開発において重要な手法です。これは、タンパク質などの大きな分子と小さな分子(潜在的な薬物)との相互作用をコンピュータ上でシミュレートする過程です。分子ドッキングは、薬物がターゲットとなるタ... 続きを読む
【分子ドッキング】 HDockを使ったタンパク質-タンパク質ドッキング【in silico創薬】 - LabCode
分子ドッキングとは? 分子ドッキングとは、薬品や生体分子(例えばタンパク質)がどのように相互作用するかを予測するコンピュータシミュレーションのことです。 特定のタンパク質と薬物がどのように結合するか、どの部分が互いに触れ合うかを計算し、その結果から薬物の効果を予測します。これは新薬開発などに非常に... 続きを読む
【分子ドッキング】 LZerD pairwise dockingを使ったタンパク質-タンパク質ドッキング【in silico創薬】 - LabCode
として保存します。2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranoseも一緒に結合していますが、こちらの部分は選択しないでください。 これによって、選択部位がfocus_leptinR.pdbとして保存されます。 これらのデータはMacintosh HD/ユーザ/自分のパソコンの名前 の階層に保存されていると思います。 以上でタンパク質の下準... 続きを読む
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